不锈钢菌种杀菌锅是利用高温杀死细菌、微生物的方法称热力灭菌。当高温作用微生物时，使细胞膜的结构变化，酶纯化，蛋白质凝固，从而使细胞死亡。根据微生物生长发育与温度的关系，可将微生物低温性微生物、中文性微生物和高温性微生物三大类。不同温度的微生物对高温问的抵抗了不同。当环境温度超过生物生长的温度范围时很容易死亡。超过的温度越高，或在高温条件下时间越长，微生物死亡越快。
多数无牙孢的杆菌80~100℃下几分钟就几乎全部死亡，但在70℃下需10~15min才能致死，而在60℃下必须30min以上才杀死。霉菌的孢子通常86~88℃加热30min即可死亡。但一些细菌的孢芽耐热性极强，在100℃下30min还能生存。
所以，灭菌彻底与否，一般以杀死细菌的芽孢为准。不同微生物对高温的耐受力也不同。一般来说，处于一般营养生长期细胞耐热性差，处于休眠状态的细胞，如各类孢子耐热性较强。菌种培养基一般建议采用蒸汽杀菌方式，不建议使用水浴式杀菌和喷淋式杀菌方式。
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