鼓励畜禽粪便这一有机肥料的综合利用，走农牧结合、种养结合的模式，最经济的做法是直接还田，在环保和畜牧业都走在世界先进行列的荷兰，牛粪经简单的干湿分离后直接还田，欧美一些发达国家还规定了每公顷土地对应的有机肥使用量。畜禽粪便除了直接还田，有条件的还可以经发酵、烘干、建沼气发电等多种合理利用形式。
福航环保自主研发山东福航新能源环保股份有限公司自主研发的智能高温好氧污泥处理设备主要是对畜禽粪便、厨余垃圾、生活污泥等废弃物进行高温好氧发酵，利用微生物的活性对废弃物中的有机质进行生物分解，使其达到无害化、稳定化、减量化、资源化利用的一体化污泥处理设备。从我国农业生产的发展和市场需求看，未来有机肥的发展潜力十分广阔。随着我国农业产业结构调整和“三绿工程”的实施，优质、高效生态农业种植面积将逐年扩大，绿色食品、有机食品生产基地的扩大必然形成对有机肥的巨大需求。与此同时，国家对改善生态环境的巨大投入必将有效拉动林、草、花卉用肥需求的迅猛增长。
总体上，由于长期忽视对固体废物的管理以及技术装备等的不足，我国的堆肥产业仍处在一个发展初期，堆肥规模、堆肥厂的数量以及堆肥工艺水平基本停留在一个粗放式的简单加工阶段，与发达国家相比距离甚远，未来各类有机固体废弃物的处理任务将十分庞大，也预示着这一产业有着广阔的发展空间。
智能高温好氧发酵设备工作原理：将废弃物(畜禽粪便、厨余垃圾、生活污泥等)、生物质(秸秆及锯末等)以及回流物料按照一定比例混合均匀，使含水率达到设计要求60-65%后进入立体好氧系统，通过调节原料的水分、氧气含量和温度变化，使物料进行充分的好氧发酵分解，分解过程中释放的热量能够使污泥自身温度增高，温度最高能够达到80℃，污泥中的水分随着温度的上升被蒸发，部分有机物被分解，从而使污泥堆体体积减小，到达污泥的减量化处理。智能高温好氧污泥处理设备通过通风、充氧、搅拌等作用控制温度在55~60℃之间，达到污泥发酵处理的温度，在此温度时，能够使污泥堆体中的大量病原菌和寄生虫死亡，同时利用除臭系统对排放的气体进行生物臭味，达到污泥无害化处理的目的。污泥高温好氧发酵后得产品，可用于土壤改良、园林绿化、垃圾填埋覆盖土等。
事实上，畜禽粪污处理发酵罐，要求不产生二次污染，处理过程中粪污不落地，有机废弃物含有大量且丰富的营养成份可供农业与饲料业使用。将动物粪便与厨余用堆肥处理可减低微生物活动及湿度，堆肥中有机质可改善土壤吸收营养与含水的能力，降低肥料使用及避免耕种时土壤流失，减少臭味与苍绳问题。虽然堆肥处理有许多好处，它并不保证解决所有的动物粪便与废弃物管理的问题。堆肥处理需要大量时间与金钱运作管理，它也需要额外的土地及三周至两个月成熟时间，野堆式堆肥及储料设施占用大量土地与建筑物空间。较大型堆肥处理操作，则为资本密集及劳力密集工作，其中最严重问题是随之而来的污染四逸及恼人的恶臭。若野堆式堆肥含有过量的氮，亚硝酸盐的臭味就成为恼人问题，超载的养分污染四逸及污染渗透则是其他另外潜在污染问题。
