由于明胶行业的特殊性，及其生产废水的特点，其污泥具有以下特性：
（1）污泥中以钙质为主，浓度高流动性差，比重大，易沉淀；
（2）污泥含有一定量的，时间久易结块；
（3）污泥量大且含有大量的石灰，pH值很高，油脂量高。
所以明胶生产废水处理中生产的污泥处理是其废水处理系统的关键，直接影响到整个处理系统的运行。青海明胶公司废水处理工程对污泥的分离主要采用：
（1）预沉处理。主要沉降比较大的污泥及骨素，通过预沉减少后续沉淀系统的负担；采用空气搅拌，防止污泥沉积堵塞水泵吸入口从而堵塞提升泵。
（2）初沉处理。经预沉处理后废水还含大量的SS，而且该废水中含有大量的根，其与钙离子将形成钙沉淀，此时的初沉池也兼做反应池。
明胶生产废水处理中生化处理存在很多难点。首先，明胶生产废水含有大量的油脂，在低温下微生物对其降解力极低；其次，明胶废水中含钙量极高，如直接采用生物膜法，载体将慢慢结垢，运行2～3个月后系统将会完全瘫痪；如采用活性污泥法，大量的钙质将会大大降低活性污泥的活性；另外，明胶生产废水中含有大量的胶原蛋白，其生化性差，而且废水含有的氯根也会严重影响生化处理效果。
针对明胶生产废水的特点，废水在进入生化池前设置了气浮工艺，通过气浮去除大部分的油脂，减少油脂对生化系统的影响；明胶废水钙含量极高，如果采用物化法将其大部分去除，不太现实，所以该生化系统采用了活性污泥法结合生物膜法（IBAF工艺），通过活性污泥结合吸附绝大部分的钙质，所以该活性污泥灰分较高，活性相对较差；而IBAF 具有很高的容积负荷，保证了明胶生产废水处理的整体去除率。
