发酵秸秆制作青贮饲料，首先要解决的就是发酵软化秸秆内部的木质纤维素，使其转化变成非常好的饲料营养，在大多的自然青贮发酵秸秆中，这部分是靠自然产生的微生物菌来完成，然后受制于数量的限制，在发酵的时候和效果上是有一定的影响的，所以在现代制作青贮的操作，越来越多的人使用 好旺农青贮发酵剂 来进行青贮操作，发酵秸秆所需的微生物菌正是好旺农发酵剂的主要成分，这些可以帮助发酵秸秆更快，保存时间也更长。
发酵秸秆饲料的原理是通过有效微生物的生长繁殖使分泌酸大量增加，秸秆中的木聚糖链和木质素聚合物酯链被酶解，促使秸秆软化，体积膨胀，木质纤维素转化成糖类。连续重复发酵又使糖类二次转化成乳酸和挥发性脂肪酸，抑制了腐败菌和其他有害菌类的繁殖，达到秸秆保鲜的目的。其中所含淀粉、蛋白质和纤维素等有机物降解为单糖、双糖、氨基酸及微量元素等，促使饲料变软、变香而更加适口。最终使那些不易被动物吸收利用的粗纤维转化成能被动物吸收的营养物质，提高了动物对粗纤维的消化、吸收和利用率。
发酵方法
1、发酵原料各种农作物秸秆、树叶杂草、瓜藤、水果渣、干蔗渣、谷壳粉、统糠、食用菌渣、鸡粪等废弃物。
2、菌种用量青贮：0.0125%，黄贮：0.025%；即250克活菌制剂做2吨青贮或者1吨黄贮。
3、菌液配制
(1)菌种活化：根据秸秆总量计算所需菌种数量，然后用5倍的温水(水温在30度左右，有条件加入少许白糖)进行2-6小时的复活。
(2)菌液配制：将复活的菌液加入水中，搅匀备用。水的用量为：秸秆含水在60%－70%，每吨秸秆补水5公斤左右，秸秆含水量40%上下，每吨补水400公斤左右，秸秆含水量20%上下(黄贮)，每吨补水1000公斤左右。(黄贮1吨麦杆、稻杆：食盐10公斤，补水1300公斤；黄贮1吨玉米秸：食盐7公斤，补水900公斤)
4、装窖
(1)分层计算：按每层厚度30厘米计算一窖分几层，再预测每层秸秆重量，由此分配每层所需菌液数量。(每层秸秆重量＝干秸秆比重×窖内面积×每层压实的厚度。玉米秸秆比重：110公斤/立方米，麦秸秆比重：100公斤/立方米)
(2)分层装窖：装铡碎的秸秆按每层30厘米的厚度进行装窖。如果黄贮秸秆，那么在每层上面加入该层秸秆重量0.5%的玉米面或麸皮粉。秸秆长度2－5厘米。
(3)分层喷洒菌液：小窖用喷壶瓢洒，大窖用小水泵喷洒。
(4)分层压实：规模小人工踩实，规模大用拖拉机轧实。
5、封窖、发酵
装到高出窖平口0.4－0.5米为止。窖顶呈馒头形，并在最上面按250克/平方米均匀地撒一层细食盐，然后用塑料膜密封，上面可加保温措施。在常温下7－10天即可开窖使用。(冬天发酵时间可延长)
质量鉴定
颜色：品质良好的青贮、黄贮其颜色基本接近青贮、黄贮前原料的颜色；中等质量的青贮、黄贮其颜色呈褐色、暗绿色；品质低劣的青贮、黄贮其颜色呈黑色、暗色、墨绿色。
气味：品质良好的青贮、黄贮具有明显的酸香味、醇香味、果香味，给人以非常舒服的感觉；品质中等的青贮、黄贮酸香味不明显，具有特别强烈的醋酸味；品质低劣的青贮、黄贮具有强烈的腐臭味。
手感：品质良好的青贮、黄贮压得很实，但拿在手里却很松散，质地柔软而湿润；品质不好的青贮、黄贮粘在一团，象烂泥一样，或者质地松散而干燥、粗硬，物理性状改变很少。
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