文冠果的茎中含有2α,3β双氢杨梅槲皮素（2α,3β-dihydromyricetin）、2α,3β-双氢槲皮素（2α,3β-dihydroguercetin）、2β,3β-表儿茶精（2β,3β-epicatechin）和2β,3β-表没食子儿茶精（2β,3β-epigallocatechin）。1998年，白玉霞等从文冠木中提取了总黄酮。1999年，张文霞等又从文冠木的醇提取物中进一步分离得到一种新的化合物，命名为文冠木素（Xanthocerin），化学名称为7,9-二羟基-4-甲基-2,4a,10,10a-四氢-吡喃并[3,2-b][1]苯并吡喃-2-酮（7,9-dihydroxy-4-methyl-2,4α,10,10α-tetrahydro-pynano[3,2-b][1]benzopyran-2-one），并首次从文冠果属植物中提取得到七叶内酯和2,5-二甲基对苯醌。1981年，王红斗等报道了文冠果种仁含油60%，并用气液色谱分析出其中含有14种脂肪酸，其中6种为不饱和脂肪酸，碳链长度C16～C18，同普通柴油的碳链长度（C15～C19）极接近。
